书接上文。
在废弃的工厂，宫野明美对柯南留下最后的遗言。
穿着蓝色小西服的柯南抱着重伤的宫野明美说：“我就知道！你是和那些幕后黑手见面的！但是没想到！我还是来迟了！”
宫野明美“咳咳！”了几声，口中突出了鲜血。这让柯南越发害怕的痛哭起来。
宫野明美安慰的说：“没事的。这就是我的命吧。到最后还是死在了组织手里。”
柯南知道她说的实话。于是问：“那么你知道组织的多少机密资料啊。”（没办法，那种程度的伤基本等不到救护车的前来。）
宫野明美用力的喘气。当感觉舒服一点后，慢慢说：“我只知道他们都是身穿黑色西服。黑色墨镜！而且搞些骇人听闻的巨大事件的组织。其他的，我根本不知道。因为我只是一名底层人员。”
柯南顿时惊慌了！因为他知道，就是那些家伙，把他害的如今这般模样。
已经不行的宫野明美用力的拽着柯南的衣服，说：“这个，是银行保险箱的钥匙，我们，我给他们的钥匙是假的。就在米花银行里的保险箱。然后，我...我...”
宫野明美最后失去了呼吸，身体慢慢的失去了温度！
柯南非常沉痛！但是他知道现在不是痛苦的时候，拿起随身携带的微型手机对暮暮警官说：“...”
虽然最后警方把已经死去的宫野明美给抬走了！（畏罪自杀。）但是由于十亿元现金最后被找到。所以就是这么的草草结案了。
在废弃工厂门口的柯南，望着明亮的月光，不知道在想些什么...
傍晚，米花银行附近的保险柜。琴酒和伏特加去宫野明美指定的地方，寻找十亿元现金中...
“哼！没想到，最后居然被宫野明美摆了一道！”
这时候，伏特加才知道，自己拿的拿把要是居然是假的！
伏特加怀疑的说：“老大！我们现在该如何是好！”
琴酒把手里的烟头随手扔掉后，说：“虽然最后被她摆了一道，但是！我们根本不在乎那十亿现金！算了走吧！执行下一步计划！”
伏特加和琴酒最后离开了那个地方...
虽然就这样风平浪静的过了三天。但是事情并没有那么容易的结束。
宫野志保（雪莉）有好长时间没有接到她姐姐给他的电话。因为她说过，只要自己没有任何意外，她每天晚上都会给她打电话报平安的。可是连续三天了！居然一个电话也没有过来。就算自己主动拨打，也不过是无人接听。结合她姐姐前几天留下来的话，她知道，自己的姐姐已经遇害了！
“我姐姐在哪里！琴酒！他是不是被你们害死了！说啊！”
这时候，正在催促药物最hou进展的琴酒碰见了大闹的雪莉。他不屑的笑了笑。说：“没错！是我们做的又如何！你和那边的关系别以为我不知道！你心里的小九九都是我玩剩下的！”
雪莉看到琴酒冷酷的目光顿时吓的瑟瑟发抖！但是她知道，这已经触犯她的底线了。所以才敢这么质问琴酒。
身穿黑色风衣的琴酒不屑的笑了笑，说：“反正，我们的计划就要成功了！与其让你背叛我们，不如让你和你姐姐一起团聚吧！”说完拿出手枪，对准了雪莉。
这时候，正在配合工作的威士忌看到了这一幕，慌忙的从研究室出来，急忙的拦下了。
“哦！你也想和雪莉一样的下场吗？”琴酒冷笑的反问。
威士忌虽然知道，如果自己的回答让琴酒丝毫的不满意，那么自己的生命也就结束了。
他思考了足足两分钟，回答：“不，我们在最后的试验，需要雪莉的协助！所以能不能先把她关押起来，然后...”
琴酒听到这个答案，满意的把枪收了回去。（如果就差那么一点就失败了，那么琴酒也会像宫野明美那样无情的丢弃。）说：“很好，你成功说服了我，伏特加，你去把雪莉带到后面的垃圾通道附近，然后用手铐把她拷上。等到最后试验成功再进行处置。”
得到指令的伏特加，要求威士忌协助。威士忌只好协助伏特加，将雪莉给带到了那里，留下了沉思的琴酒。
“这一步计划又成功了！下面就看雪莉的本事了！我想，如果她成功的逃脱，那么可以利用这把双刃剑，给朗姆他们一个狠狠的巴掌。”随后，他离开了研究所走廊！去到休息室中...
过了大概1个小时，穿着白色研究服的雪莉确定他们短时间不再出现后，偷偷的用右手，从口袋里拿出APTX4869。心想“反正，如今走到这一步了，不如拿出这个偷偷带出的药试一下！反正大不了一死！如果成功了，说不定就可以离开了组织！”
想通的雪莉，立马把APTX4869服下，并且拿着给她放置的瓶装矿泉水配合服下。（这是最基本的对待。你总不能不然她喝水吧。）三分钟过去后，雪莉全身痛苦！然后...
晚上8点，伏特加拿着给雪莉晚饭的便当，准备给雪莉送去的时候，惊讶的发现！雪莉居然不见了！
“老大，雪莉不见了！这里已经不安全了。如果她报警把我们给...”
“放心把，伏特加，这也是我的计划中的一部分！好了我们该去做最后的善后工作了！”
“是的，老大。”伏特加虽然不知道琴酒的计划到底是什么，但是还是忠实的执行了琴酒的命令。
（我也不知道，琴酒的计划是什么！但是我知道雪莉出现在柯南身边，没有那么简单。最起码和阿里博士有着千丝万缕的关系。因为其中有一集暗示着阿里家族实际上也是深藏不露的。具哪集我忘了。但这也解释了，为什么雪莉会出现在阿里博士家门口，这个奇怪的举动。）
“彭！”研究所传来了一阵爆炸声！
琴酒和伏特加看着燃烧的研究所，满意的离开了那里。随后听见了消防车和警车赶往那里的警笛声音。
（当然，那些研究员则是另外乘坐车辆有序离开研究所。最后琴酒和伏特加负责善后，因为他不放心除了自己的所有人。）
阿里博士家门口，阿里博士又做了个失败的试验，他唉声叹气道：“哎！又失败了！我到底什么时候才能成功，向自己的亲戚展现自己的价值呢？”（他根本不知道，自己的部分资金就是黑色组织直接高价购买他的专利，来给他送钱的。）
“叮咚！叮咚！”
“真是的！下雨天还要有人拜访！真是让人不爽！”虽然如此，但是阿里博士还是穿上红色毛衣，打上雨伞看看到底是谁。
“救我，好吗！求求你！”随后，一名7岁的小女孩倒在了阿里博士家门口。（此时倾盆大雨，虚弱的雪莉已经没有一点爬起来的力气。身体非常的发烫！显然，她就是穿着薄薄的研究员的白色制服，艰难的跑到了这里。）
阿里博士看到如此虚弱的雪莉后，急忙的抱起，把她放到沙发上，给他服用温水，还有退烧药。
过了1个小时，雪莉感激的看向了阿里博士。
阿里博士嘿嘿一笑，问：“哎，别起来，我去给你煮点面条吃。”说着就去厨房给她准备夜宵。
恢复神智的宫野志保慢慢的介绍为什么来这里，还有自己到底是谁的时候。阿里博士大惊！（这也是为了柯南的安全嘛。）
阿里博士问：“那你以后到底该怎么办！”
雪莉哀伤的回答：“要不，我先上学吧。顺便和你所说的柯南一起...”
阿里博士又问：“那么你的名字叫什么为好！”
雪莉想了想，回答：“灰原哀！”
阿里博士这时候，想了想问：“那么你知道APTX4869的解药吗？”（为了让柯南恢复原来面貌。）
雪莉摇摇头，说：“虽然我会做，但是需要复杂的材料。还有我从来没有试验成功过，所以...”
阿里博士失望的摇摇头，表示你就在这里好好住下吧。上学的事情我来处理！随后度过了那看似平静的夜晚...